MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus H10 plasmid pH10

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017468	T	7	7	40	46	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017468	ATA	2	6	65	70	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017468	T	6	6	105	110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017468	T	6	6	157	162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017468	AAT	2	6	174	179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017468	A	6	6	185	190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017468	CAAA	2	8	221	228	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017468	AGT	2	6	235	240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017468	A	7	7	253	259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017468	ATA	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017468	ATT	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017468	TTCG	2	8	1904	1911	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017468	T	6	6	1989	1994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017468	A	7	7	2054	2060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017468	TAC	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017468	GCCA	2	8	2081	2088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017468	AAC	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017468	GTT	2	6	2115	2120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017468	TATT	2	8	2519	2526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017468	AAT	2	6	2540	2545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017468	ATT	2	6	2565	2570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017468	TAT	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017468	T	6	6	2713	2718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017468	TAAA	2	8	2721	2728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017468	A	6	6	2731	2736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017468	TCG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017468	TAA	2	6	2811	2816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017468	A	8	8	2837	2844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017468	GAA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017468	A	6	6	3541	3546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017468	CTT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017468	CTA	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017468	GGT	2	6	4738	4743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017468	TTG	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017468	A	8	8	4893	4900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017468	TTA	2	6	4930	4935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017468	TAT	2	6	5016	5021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017468	T	6	6	7178	7183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017468	CTTTG	2	10	9577	9586	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017468	GTT	2	6	9599	9604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017468	TGT	2	6	13418	13423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017468	ATTC	2	8	13473	13480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017468	CTG	2	6	13517	13522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017468	T	6	6	14185	14190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017468	CCT	2	6	14978	14983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017468	ATT	2	6	15001	15006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017468	TCT	2	6	15049	15054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017468	GT	3	6	15078	15083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017468	AAC	2	6	15093	15098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017468	AG	3	6	16426	16431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017468	TGTC	2	8	16535	16542	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017468	T	6	6	16576	16581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017468	CAA	3	9	16588	16596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017468	A	6	6	16595	16600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017468	ATTT	2	8	16644	16651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017468	T	7	7	16649	16655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017468	TAAT	2	8	16695	16702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017468	T	6	6	16827	16832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017468	ATT	2	6	16844	16849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017468	T	6	6	16848	16853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017468	CTT	2	6	16933	16938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017468	TTA	2	6	18392	18397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017468	TTTC	2	8	18420	18427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017468	A	7	7	19671	19677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017468	A	6	6	19693	19698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017468	AAT	2	6	19717	19722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017468	GCT	2	6	19738	19743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017468	TC	4	8	19762	19769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017468	GA	3	6	19851	19856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017468	AAG	2	6	19934	19939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017468	ATA	2	6	19953	19958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017468	AGT	2	6	20019	20024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017468	AT	3	6	20153	20158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017468	TCT	2	6	20185	20190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017468	TCC	2	6	20221	20226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017468	GTA	2	6	20247	20252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017468	ATCA	2	8	20283	20290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017468	AC	3	6	20316	20321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017468	GAT	2	6	20338	20343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017468	ATTAT	2	10	20353	20362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017468	TAT	2	6	20368	20373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017468	AT	3	6	20405	20410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017468	TTA	2	6	20429	20434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017468	TTA	2	6	20448	20453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017468	AATA	2	8	20463	20470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017468	TAC	2	6	20483	20488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017468	GAA	2	6	20505	20510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017468	TGA	2	6	20587	20592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017468	TTA	2	6	20611	20616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017468	A	7	7	20624	20630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017468	T	6	6	20681	20686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017468	AAG	2	6	20786	20791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017468	CAG	2	6	20865	20870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017468	AATAAA	2	12	21007	21018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017468	TAA	2	6	21028	21033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017468	TG	3	6	22044	22049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017468	ATAA	2	8	22074	22081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017468	TCC	2	6	22151	22156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017468	ATG	2	6	22234	22239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017468	TGC	2	6	22285	22290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017468	ATA	2	6	22291	22296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017468	ATT	2	6	23659	23664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017468	AAT	2	6	24744	24749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017468	GCTC	2	8	26370	26377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017468	ATT	2	6	26429	26434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017468	A	7	7	26475	26481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.